Principalmente, se trata de estilo, pero la respuesta depende un poco del contexto. Por lo general, se usaría «en» en lugar de «en». «Al comienzo de la semana» también es aceptable dependiendo de lo que esté describiendo, pero «Al comienzo de la semana» suena poco natural para un hablante nativo, porque «comienzo», a diferencia de «comienzo», tiene un significado que es más relacionado con el  instante  que algo comienza. 
 Encontré todas estas frases en  The New York Times  usando Google: 
  Al comienzo de la semana  eran un grupo provisional 
  Al comienzo de la semana , eso suena bastante bien. 
 La ganancia podría han sido más amplios, dijeron los minoristas, si el período de clima fresco  al comienzo de la semana  se hubiera extendido. 
 Por lo tanto, puede estar seguro de que esos tres usos son aceptables, pero nuevamente, probablemente desee usar «at» en lugar de «in». 
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