A pergunta é vaga, mas de improviso aqui estão algumas coisas a serem consideradas.

Compatibilidade

• Certifique-se de que sua hardware é compatível,
  alguns hardwares têm suporte insuficiente ou não são compatíveis.
  Observação: no momento em que este artigo foi escrito, a NVIDIA tinha suporte muito melhor para renderização de GPU do que qualquer outro hardware, mas isso pode mudar com os mais novos drivers & hardware.
• Os nomes dos caminhos diferenciam maiúsculas de minúsculas (se você compartilha projetos com sistemas ms-windows, deve cuidar disso, pois ms-windows não faz distinção entre maiúsculas e minúsculas).
• Ao contrário do OSX, o Linux não suporta codecs Quicktime. Isso significa que alguns formatos (como gif) não podem ser carregados. Embora o Blender use FFMPEG, que suporta muitos formatos de vídeo (entrada & saída).

Desempenho

• Linux (e a cadeia de ferramentas associada) provou ser mais rápido em algumas áreas (muitos usuários relatam tempos de renderização mais rápidos com Cycles, por exemplo) . Mas isso depende da sua configuração exata.
  A capacidade de executar o Blender sem desktop gráfico para usar toda a memória disponível também pode ser uma vantagem (especialmente para fazendas de renderização).
• O Blender para Linux tira vantagem de um alocador de memória de alto desempenho (jemalloc), que é menos sujeito à fragmentação de memória, consulte:
  
  • página inicial do jemalloc
  • Sintel, benchmarks do Blender Jemalloc
  • como-faz-jemalloc-funciona-quais-são-os-benefícios
• Parte do código do Blender tira proveito de otimizações de compilador que não estão disponíveis no compilador da Microsoft (MSVC): (reordenação explícita do branch com __builtin_expect e macros mais eficientes com statement expressions ) .
• Mais opções para compiladores (GCC, Clang, IntelC ++) são suportados no Linux, mas apenas M SVC é compatível com ms-windows.

Com a capacidade de inicializar de uma unidade externa, você pode testar o quão bem o Linux é executado e se ele suporta seu hardware, antes de instalar em seu sistema.

Notas:

• algumas das vantagens que listei para Linux também são vantagens para MacOSX, FreeBSD
• MS-Windows + MSVC também são tecnologias avançadas e, sem dúvida, têm algumas vantagens sobre Linux + GCC … ou outros compiladores … (sua-milhagem-pode-variar) .
• O questionador pergunta sobre o Ubuntu , no entanto, este não é realmente um detalhe importante (prós / contras também se aplicam a outras distros populares).

Outra consideração é que, dependendo do ambiente de trabalho que você usa no Linux, alguns dos atalhos de teclado para o blender podem não funcionar, já que os atalhos para o sistema operacional têm precedência. Para consertar isso, você pode precisar alterar os atalhos do Ambiente de Trabalho para teclas não utilizadas no blender (normalmente a tecla Super ou Windows ).

Outro problema você pode se deparar é que as versões do blender em certos repositórios do Linux não estão atualizadas ou não foram instaladas corretamente. Para ignorar os repositórios, você sempre pode baixar o blender diretamente de http://www.blender.org/download/

Nem todas as distribuições do Linux fornecem a mesma funcionalidade. Alguns codecs de renderização de vídeo não estão disponíveis na configuração padrão do Fedora Linux, por exemplo, e devem ser instalados separadamente.